導言
文章
秦始皇論（1873）
漢武帝論（1873）
班超論（1873）
宋論（1873）
六國論（1874）
諸葛亮論（1874）
晉武帝論（1874）
謝安論（1874）
唐太宗論（1874）
《唐書·四夷傳》論（1874）
寇準論（1874）
王安石論（1874）
岳麓書院六君子序贊（1874）
與李荔蓀書（1878）
重修屈賈合祠啟（1879）
宣平與黃鈞甫書（1880）
告伍公廟文（1881）
出都與程伯翰書（1883）
滬上寄都中友人書（1883）
與王懷欽書（1883）
征刻朱文端公藏書十三種啟（1892）
尚書古文疏證辨正自序（1892）
虙戲畫卦頌（1893）
舜陵銘（1893）
春秋列國名臣序贊（1893）
漢云臺中興諸將序贊（1893）
唐十八學士序贊（1893）
復王子庚書（1894）
《史通·惑經》篇書后（1894）
《史通·申左》篇書后（1894）
孔融薦禰衡論（1894）
章實齋《文史通義》書后（1895）
孝經鄭注疏自序（1895）
豫章叢書第三集序（1895）
尚書大傳疏證自序（1895）
兩漢詠史詩自序（1895）
史記引尚書考自序（1895）
宙合堂談古自序（1895）
茅批《唐宋八家文》書后（1895）
古文尚書冤詞平議自序（1895）
請復孝弟力田科議（1895）
張孝達制軍壽序（代）（1896）
漢大司農鄭公碑（1896）
今文尚書考證凡例（1897）
致張野秋學使書（1897）
南學會講義（1898）
南學會答辜天祐問（1898）
南學會答黃日華問（1898）
南學會再答辜天祐問（1898）
答葉煥彬吏部書（1898）
再答葉煥彬吏部書（1898）
致熊秉三譚復生諸君書（1898）
上陳右銘方伯書（1898）
賀黃公度廉訪書（1898）
南昌江南會館演講（1898）
同心會序（1898）
致陳伯嚴同年書（1898）
致梁卓如書（1898）
上陳右銘年伯書（1898）
圣證論補評自序（1899）
六藝論疏證自序（1899）
魯禮禘祫義疏證自序（1899）
鄭志疏證自序（1899）
尚書中候疏證自序（1899）
駁五經異義疏證自序（1899）
發墨守箴膏肓釋廢疾疏證自序（1899）
致門人賀贊元（1899）
書劉光伯自贊后（1901）
古泉雜詠序（1901）
善化小學堂開學演講（1902）
鑒古齋日記序（1902）
鑒古齋日記評語選（1902）
湖南師范館經學講義（1903）
湖南師范館倫理講義（1903）
天津寄王益吾閣學書（1903）
長蘆鹽法志例言（1903）
纂修《長蘆鹽法志》條議（1903）
分類編次十朝上諭凡例（1903）
劉氏譜序（1904）
漢碑引經考附引緯考自序（1905）
經學通論自序（1907）
王制箋自序（1907）
四川易古田先生遺說序（1907）
上吳子修學使書（1907）
消夏百一詩序（1907）
應詔陳言謹擬增訂學堂章程六條摺（1907）
李荔村同年遺詩序（1907）
教育論（1908）
專著
經學歷史（1906）
書經通論（1907）
春秋通論（1907）
皮錫瑞年譜簡編