第1章 緒論 1.1 生物信息學(xué)的概念 1.2 生物信息學(xué)發(fā)展簡(jiǎn)史 1.3 信息融合與關(guān)聯(lián)分析 1.4 研究工具 第2章 關(guān)聯(lián)分析 2.1 關(guān)聯(lián)規(guī)則 2.2 序列模式 2.3 子圖模式 2.4 非頻繁模式 2.5 橋接模式 2.6 詞向量 2.7 隨機(jī)游走 2.8 知識(shí)推理 2.9 本章小結(jié) 第3章 復(fù)雜網(wǎng)絡(luò) 3.1 圖論概述 3.2 網(wǎng)絡(luò)的統(tǒng)計(jì)量和結(jié)構(gòu)相似性 3.3 主要網(wǎng)絡(luò)模型 3.4 復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)的動(dòng)力學(xué)傳播 3.5 復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)的復(fù)雜結(jié)構(gòu) 3.6 復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)的應(yīng)用 3.7 本章小結(jié) 第4章 計(jì)算語言學(xué)與生物序列 4.1 計(jì)算語言學(xué) 4.2 形式語言理論 4.3 生物序列與關(guān)聯(lián)分析 4.4 語言理論的計(jì)算應(yīng)用 4.5 核酸的結(jié)構(gòu)語言學(xué) 4.6 生物序列的功能語言學(xué) 4.7 進(jìn)化語言學(xué) 4.8 本章小結(jié) 第5章 非編碼RNA功能與結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè) 5.1 非編碼RNA概述 5.2 非編碼RNA的分類 5.3 常見非編碼RNA的功能 5.4 非編碼RNA結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè) 5.5 本章小結(jié) 第6章 非編碼RNA與疾病關(guān)系 6.1 非編碼RNA-疾病關(guān)系幾種嵌入模型 6.2 非編碼RNA-疾病關(guān)系預(yù)測(cè) 6.3 本章小結(jié) 第7章 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè) 7.1 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)概述 7.2 蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù) 7.3 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè) 7.4 蛋白質(zhì)相互作用熱點(diǎn)預(yù)測(cè) 7.5 本章小結(jié) 第8章 基因序列組裝和應(yīng)用 8.1 基因測(cè)序