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二穗短柄草中抗病基因家族的分析及機器學習預測方法研究 版權信息
- ISBN：9787568921817
- 條形碼：9787568921817 ; 978-7-5689-2181-7
- 裝幀：暫無
- 冊數：暫無
- 重量：暫無
- 所屬分類：>
二穗短柄草中抗病基因家族的分析及機器學習預測方法研究 本書特色
本文詳細分析了模式植物二穗短柄草中抗病基因家族NBS—LRR的特征，研究了怎樣從其全基因序列中鑒定抗病基因家族及各基因家族內成員的特征，并詳細分析了這些抗病基因亞類型、結構域、進化信息、染色體定位等眾多序列特征，然后根據這些序列特征，研究了從這些抗病基因序列中抽取離散特征向量的方法，并應用不同的機器學習方法對NBS—LRR抗病基因家族進行模型構建，并選擇支持向量機作為一種機器學習模型進行模型參數選擇和參數優化方法，*后研究了應用構建好的預測模型對其它經濟作物全基因組序列進行抗病基因的預測、抗病基因的注釋和分類的一站式分析平臺的構建方法。
二穗短柄草中抗病基因家族的分析及機器學習預測方法研究 內容簡介
本文詳細分析了模式植物二穗短柄草中抗病基因家族NBS-LRR的特征, 研究了怎樣從其全基因序列中鑒定抗病基因家族及各基因家族內成員的特征, 并詳細分析了這些抗病基因亞類型、結構域、進化信息、染色體定位等眾多序列特征, 然后根據這些序列特征, 研究了從這些抗病基因序列中抽取離散特征向量的方法, 并應用不同的機器學習方法對NBS-LRR抗病基因家族進行模型構建, 并選擇支持向量機作為一種機器學習模型進行模型參數選擇和參數優化方法, *后研究了應用構建好的預測模型對其它經濟作物全基因組序列進行抗病基因的預測、抗病基因的注釋和分類的一站式分析平臺的構建方法。
二穗短柄草中抗病基因家族的分析及機器學習預測方法研究 目錄
1 緒論
1.1 植物抗病基因概述
1.2 植物抗病基因研究中的生物信息學
1.3 常用生物信息學數據庫和分析軟件
1.4 本書的技術線路圖
1.5 本書的主要內容
1.6 本書的目的和意義
2 二穗短柄草抗病基因家族NBS.LRR的鑒定與生物信息學
分析
2.1 引言及研究動機
2.2 數據與方法
2.3 結果與分析
2.4 討論與小結
3 二穗短柄草NBS.LRR抗病基因家族的表達譜分析
3.1 引言及研究動機
3.2 基因表達譜分析的常用技術
3.3 實驗數據的獲取
3.4 結果與分析
3.5 討論與小結
4 NBS—LRR基因家族預測算法的設計與應用
4.1 研究背景
4.2 方法與數據集
4.3 結果與分析
5 總結與展望
5.1 主要研究結果
5.2 創新點
5.3 展望
附錄
附錄l 縮略詞簡表
附錄2 NBS—LRR抗病基因列表
附錄3 二穗短柄草中我們鑒定出的126個典型的NBS—LRR抗病基因的蛋白序列
附錄4 NBS一LRR抗病基因的基因簇分布
附錄5 氨基酸的部分理化性質簡表
附錄6 擬南芥中的正負樣本序列列表
附錄7 NBS—LRR抗病基因的蛋白序列結構域特征
參考文獻
1.1 植物抗病基因概述
1.2 植物抗病基因研究中的生物信息學
1.3 常用生物信息學數據庫和分析軟件
1.4 本書的技術線路圖
1.5 本書的主要內容
1.6 本書的目的和意義
2 二穗短柄草抗病基因家族NBS.LRR的鑒定與生物信息學
分析
2.1 引言及研究動機
2.2 數據與方法
2.3 結果與分析
2.4 討論與小結
3 二穗短柄草NBS.LRR抗病基因家族的表達譜分析
3.1 引言及研究動機
3.2 基因表達譜分析的常用技術
3.3 實驗數據的獲取
3.4 結果與分析
3.5 討論與小結
4 NBS—LRR基因家族預測算法的設計與應用
4.1 研究背景
4.2 方法與數據集
4.3 結果與分析
5 總結與展望
5.1 主要研究結果
5.2 創新點
5.3 展望
附錄
附錄l 縮略詞簡表
附錄2 NBS—LRR抗病基因列表
附錄3 二穗短柄草中我們鑒定出的126個典型的NBS—LRR抗病基因的蛋白序列
附錄4 NBS一LRR抗病基因的基因簇分布
附錄5 氨基酸的部分理化性質簡表
附錄6 擬南芥中的正負樣本序列列表
附錄7 NBS—LRR抗病基因的蛋白序列結構域特征
參考文獻
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