第1章總論1 1.1國內外發展趨勢與現狀2 1.2建設的必要性5 1.3上海設施建設的目標8 1.4建設歷程9 1.5科學意義和社會效益15 1.6推進分類改革，“率先行動”爭創一流17 參考文獻18 第2章規模化蛋白質制備系統19 2.1規模化蛋白質制備系統概述19 2.2系統建設目標、技術方案和驗收指標20 2.3規模化克隆和蛋白質可溶性篩選模塊22 2.4多種體系蛋白質表達模塊32 2.5大規模蛋白質純化模塊49 2.6蛋白質性質表征模塊52 2.7自動化結晶和觀察模塊53 參考文獻56 第3章蛋白質晶體結構分析系統57 3.1科學目標與建設目標57 3.2系統構成與系統設計59 3.3蛋白質微晶體結構線站（BL18U1）60 3.4蛋白質復合物晶體結構線站（BL19U1）83 3.5高通量晶體結構線站（BL17B1）93 3.6線站總體102 3.7束線調試及驗收測試110 3.8運行開放以及用戶成果138 參考文獻138 第4章蛋白質動態分析系統140 4.1同步輻射生物X射線小角散射線站140 4.2同步輻射紅外譜學線站175 參考文獻212第5章核磁分析系統215 5.1核磁系統概述215 5.2核磁系統的初步設計方案216 5.3核磁設備的安裝、調試、驗收233 5.4核磁系統的開放運行成果250 參考文獻253 第6章電鏡分析系統255 6.1科學目標與建設目標255 6.2電子顯微鏡257 6.3透射電鏡樣品的基本制備技術269 6.4電鏡數據的收集及處理287 6.5電鏡系統的工藝測試與驗收295 6.6電鏡系統用戶成果介紹300 參考文獻303 第7章質譜分析系統305 7.1科學目標與建設方案305 7.2蛋白質樣本制備模塊310 7.3蛋白質高分辨鑒定模塊320 7.4蛋白質修飾的規模化分離和定位模塊325 7.5功能蛋白質及其相互作用的定量分析模塊327 7.6安裝調試329 7.7測試驗收339 7.8用戶開放成果354 參考文獻371 第8章復合激光顯微鏡系統374 8.1科學目標375 8.2工程工藝設計377 8.3設備的到貨、安裝與調試379 8.4測試與驗收395 8.5運行開放與用戶成果427 參考文獻440 第9章分子影像系統442 9.1系統概述442 9.2系統設計方案443 9.3系統安裝、調試及研究計劃451 9.4系統測試與驗收453 9.5系統開放運行成果469 參考文獻473 第10章用戶開放服務475 10.1用戶服務管理流程475 10.2用戶會議及培訓476 10.3用戶成果管理478 參考文獻488 索引489