卷一 陰陽顛倒篇 順逆探原篇 回天生育篇 天人壽夭篇 命根養生篇 救母篇 紅鉛損益篇 初生微論篇 骨陰篇 卷二 媾精受妊篇 社生篇 天厭火衰篇 經脈相行篇 經脈終始篇 經氣本標篇 臟腑闡微篇 考訂經脈篇 包絡配腑篇 卷三 膽腑命名篇 任督死生篇 陰陽二蹺篇 奇恒篇 小絡篇 肺金篇 肝木篇 腎水篇 心火篇 卷四 脾土篇 胃土篇 包絡火篇 三焦火篇 膽木篇 膀胱水篇 大腸金篇 小腸火篇 命門真火篇 卷五 命門經主篇 五行生克篇 小心真主篇 水不克火篇 三關升降篇 表微篇 呼吸篇 脈動篇 瞳子散大篇 卷六 診原篇 精氣引血篇 天人一氣篇 地氣合人篇 三才井論篇 五運六氣離合篇 六氣分門篇 六氣獨勝篇 三合篇 卷七 四時六氣異同篇 司天在泉分合篇 從化篇 冬夏火熱篇 暑火二氣篇 陰陽上下篇 營衛交重篇 五臟互根篇 八風固本篇 卷八 八風命名篇 太乙篇 親陽親陰篇 異傳篇 傷寒知變篇 傷寒同異篇 風寒殊異篇 陰寒格陽篇 春溫似蘞篇 卷九 補瀉陰陽篇 善養篇 亡陽亡陰篇 晝夜輕重篇 解陽解陰篇 真假疑似篇 從逆窺源篇 移寒篇 寒熱舒肝篇